Заповедник — уникальная лаборатория природы под открытым небом. Естественные процессы, протекающие на этой заповедной территории, изучают специалисты разных профилей и направлений — териологи, орнитологи, энтомологи, геоботаники, почвоведы.
Сотрудники научного отдела
Научные сотрудники – 12 (2 доктора биологических наук, 4 кандидата биологических наук); Инженеры – 3 (2 с высшим образованием, 1 со средним специальным); Лаборант – исследователь – 1 (со средним специальным); Библиотекарь – 1 (с высшим образованием).
Краниологическая лаборатория
Лаборатория создана в феврале 1993 года с целью лучшей организации сбора коллекционного териологического материала и координации деятельности заповедников лесной зоны европейской части России по созданию банка информации по биоразнообразию.
Торопецкий опорный пункт
Научная деятельность сотрудников опорного пункта направлена на изучение экологии бурого медведя. В основе исследования – изучение поведения бурого медведя на особо охраняемых территориях и территориях, подверженных антропогенному воздействию.